
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应绘制淀粉酶组学产品,实现1000+玄之又玄度呈现位点排除,维持复现经典传奇靶点,全方法生信概述解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“显示”到“确认”全程序服務,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、检测程序
02、测试的数据
03、经“点”初现
在实测值数据报告中,检测两个文献综述中简讯的精品靶点名词解释衣康酸体现位点,如首个被发展的衣康酸共价体现淀粉酶KEAP1,另外糖酵解环路中的3个重要性酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,同时炎性小体组合而成淀粉酶NLRP3和受损细胞烂掉方式中的重要性淀粉酶RIPK3等,其质谱图一下图一样。
04、成品基本特征
1.多种质控
企业化特情人电极孵育、SDS-PAGE测量、WB认证、范本重要性性定性分析等多方面位测量,狠抓大型项目导致靠普性。2.高耐磨性质谱检测仪器手机平台
在Orbitrap Astral全第七代人高辨认质谱仪作明佛母心咒下,建立衣康酸性反应修饰语位点及球蛋白检测新强度,促动科学性科研新知道。3.全具体流程一走式功能
系统设计拜谱生物技术逐步完善的实验所公司,可供应“内部致力于→电极孵育→WB判断工具→玄妙度衣康碱化淡化判断工具→独有生信研究→当前位点PRM印证”全步骤服务保障,省时省钱更放心。05、分析一下知识(区域)
06、拜谱生物领域
PART 2、论文参考文献分享图片
专著一
英文音标主题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文名字大标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
设计信息内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
医学文献二
日文标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文版题目:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
深入分析玩法:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、经典案例诞生总体目标
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13有着不强的底物紧密联系程度,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物制品衣康碱化呈现组实测值数据文件中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化呈现(方式图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结ppt
对于TCA配置中的前面分泌物,衣康酸调低分泌、免役力和细菌感染中间的上下级功用,为方法免役力细菌感染性急病带来了了方式方法营销策略。衣康酸结构类型设计中的亲电性α,β-不达到饱和状态羧酸结构类型设计能对淀粉酶质上的抗逆性半胱氨酸残基开始烷基化体现语(迈克尔暴伤不良反应),这种翻译工作后体现语被称呼“衣康酸体现语(itaconation)”,从而作用淀粉酶质作用,调节管控免役力对答和分泌路径,为不同急病中药科研带来了新构思。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化修饰语蛋白酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学专业坚决定量分析靶向疗法代谢率组(QMT1000)或能量场排泄靶点排泄组产品的对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
分类期刊论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.