
近日,东莞医科大专第一名附屬医院科室王学浩博士开发团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向疗法消耗的能量产生检测分析服务。
用英文怎么说版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕微信标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
大家标准:南京医科大学
的研究材料:细胞
拜谱能提供工作:转录组测序+球蛋白互作组+靶向药物电能分泌组
技艺路经:
研究分析后果
01、YBX1被签别为HCC中糖酵解的根本遗传基因
本研发爬取HCC肺部肉瘤子样本(n=7)的单公司RNA测序数剧集来进行概述,找到糖酵解吸附性最主要的集中授课在肺部肉瘤公司中,hdWGCNA概述辨别出9个染色体模块电源(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的荒岛存活概述选择YBX1为经济独立荒岛存活安全隐患方面(图1H)。进两步融入IHC、WB实验所和肺部肉瘤公司与紧邻非肺部肉瘤公司的的空间转录组学数剧集核实YBX1是肝公司癌诊疗的存在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被知道为调结HCC細胞糖酵解的重点的因素
02、YBX1提高HCC中的有氧糖酵解和繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法能量场新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有助于HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1结合实际并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1搭配并提高YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化加强其磷碱化,最终得以促使其核转位
进那步的检测YBX1的O-GlcNAc糖基化有没的影响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC上皮神经细胞中或用OGT克剂型OSMI-1治理 ,YBX1淀粉酶技术标准正相关下降,YBX1磷硝化作用正相关削减(图4A-C)。IP實驗现示,在一模一样的Flag-YBX1底物技术标准下,YBX1-WT的磷硝化作用技术标准正相关不低于YBX1-T57A,反映磷硝化作用的添加不光仅是鉴于挺高的YBX1淀粉酶表述(图4D)。转移了核和质多组分发掘TMG治理 的HCC上皮神经细胞中YBX1核表述的增大(图4E-F),进那步发掘YBX1磷硝化作用的关键点调控系数是AKT(图4G-I)。那些发掘推崇O-GlcNAc糖基化完成促使其磷硝化作用来强化YBX1淀粉酶动态平衡性并促使核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖有便于其逐步一个脚印形成磷硝化作用遮盖并可以提高其核转位
05、YBX1使得PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1加速PKM2转录
06、YBX1 也能加强组蛋清乳硝化作用表达的水平
实验所知道YBX1敲低相关系数消减蛋清质乳硝化为用,特别是在是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解控注射剂2-DG的实验所否认了糖酵解与组蛋清乳硝化为用的随时关联关系,控制糖酵解可相关系数消减H3K18la关卡(图6D)。PKM2过抒发不可逆转转YBX1敲低造成的H3K18la减退,以外源乳酸外理实际上不断提升H3K18la,还引发YBX1抒发上涨,信息提示具备正在向反馈机制化(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR否认,H3K18la用含有于YBX1开机子随时增进其转录,该环节受O-GlcNAc糖基化自我调节(图6H-J),并知道P300 上涨是YBX1增加H3K18乳酰化为用的机制化(图6K-L)。
图6.YBX1增强学习H3K18乳碱化淡化技术
好的文章工作小结
在某项科学研究中通讯报道了YBX1在HCC中高表述,还有与糖酵解开切相应。YBX1在T57处被O-GlcNAc呈现,最后不稳血清质并加强其表述。一种呈现还利于YBX1在T57处的磷酸性反应,利于其核易位。从而,这种进程增强学习了糖酵解相应dna的转录并多种多样乳酸的制造。与此同时,YBX1刺激P300的转录,因此驱使组血清的乳酸性反应,特备是H3K18la,H3K18乳酸性反应正在向宏观调控YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传的正负极馈环管理机制图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点能量场代谢转化组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、汉语翻译后淡化组学、分解代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
关联性论文参考文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.